רדיוס האטום מתואר כמרחק מהגרעין שלו לאלקטרונים החיצוניים ביותר שלו. למרות שאי אפשר לדעת את המיקום המדויק של האלקטרונים הללו, ניתן עדיין לקבוע קירוב מאוד קרוב לרדיוס של אטום על ידי מדידת המרחק מהגרעין שלו לזה של האטום אחר שהוא נקשר אליו. בקשר קוולנטי - שנוצר על ידי אלקטרונים משותפים - ההנחה היא ששני האטומים הם באותו גודל, ואת המרחק בין הגרעינים של שני האטומים ניתן לחלק לחצי כדי למצוא את הרדיוס שלהם. במקרה של קשרים יוניים, אטום אחד גדול מהאחר, ויש לדעת את רדיוס אחד האטומים כדי לקבוע את רדיוס האחר.
קבע איזה סוג קשר קיים בין שני האטומים; הרדיוס יחושב אחרת תלוי אם הוא קוולנטי או יוני.
חלקו את המרחק בין גרעיני האטומים לשניים אם הקשר הוא קוולנטי. לדוגמה, אם אתה יודע שהמרחק בין הגרעינים של שני אטומים קשורים קוולנטיים הוא 100 פיקומטר (pm), הרדיוס של כל אטום נפרד הוא 50 בערב.
מחסירים את הרדיוס של אחד האטומים מהמרחק הכולל בין הגרעינים אם הקשר הוא יוני. לדוגמה, אם הרדיוס של אחד האטומים הוא 60 בערב, והמרחק בין הגרעינים של שני האטומים הוא 160 בערב, הרדיוס של האטום האחר הוא 100 בערב.