תוֹכֶן
המערכת האקולוגית הימית נמצאת תחת לחץ קשה; בתחומים רבים התנאים הדרושים לקיום חיים הם בסכנה או שאינם קיימים. הרס בתי הגידול הימיים נפוץ במיוחד לאורך חופי הים שבהם גדלה אוכלוסיית האדם. אובדן בית גידול, זיהום, דיג יתר, נוהגי דיג הרסניים והתחממות כדור הארץ כל אלה מערערים את הסביבה הימית.
קווי חוף
אובדן בתי גידול, זיהום, נגר ומליחות מוגברת הורסים שוניות אלמוגים, עשב ים ובתי גידול אחרים לעופות ודגים. עם מילוי של שטחי מים רטובים בחוף כדי לאכלס אוכלוסיות אנושיות הולכות וגדלות, סתימת הנהרות מפחיתה את זרימת המים המתוקים, מאטה את נגרם התזונתי ומעכבת את נדידת הדגים. פחות מים מתוקים פירושם מליחות מוגברת בשפכים ובשפכים, מה שפוגע בעשבים המטהרים מים בזמן שהם זורמים לים. סחף שנגרם כתוצאה מיערוך יערות בנהרות, נחלים ובסופו של דבר לאוקיאנוס, וחוסם את אור השמש הדרוש לשוניות האלמוגים כדי לשרוד.
דיג יתר
התשואה המרבית בת-קיימא מחושבת על ידי ביולוגי הדייג כדי להעריך את כמות הדגים הניתנים לקצור מאוכלוסייה מבלי להסתכן בכדאיותו לטווח הארוך. בין 1974 ל -1999, שילש שיעור הדייג שעבר את התשואה המקסימלית בר קיימא עבור בקלה, בין 10 אחוז ל -30 אחוז. על פי המרכז לפתרונות אוקיינוס, מאז תחילת שנות התשעים התפוקה הכוללת באחד מהדגים היצרניים ביותר בעולם, ים אוקוצק, פחתה בין שתי פעמיים ופעמיים וחצי בגלל דיג יתר. באוקיאנוס השקט, יותר ממחצית מדינות האי אינן מנהלות ברציפות את שוניות האלמוגים שלהן.
רצפת ים
אוניות דיג מסחריות גוררות רשתות גדולות המחוברות למשקולות כבדות מעבר לקרקעית הים, תוך שימוש בתרגול המכונה טרילינג בתחתית. מינים ממוקדים כוללים שרימפס, בקלה, סוליה, ושיבוץ, אך כל מה שנמצא לאורך קרקעית הים נתפס. דיג של קרקעית תחתונה יכול להשאיר את המערכת האקולוגית הימית פגועה לצמיתות והתפוסה העיקרית (מינים שאינם מטרה כמו צבי ים, עופות ים ויונקים) פשוט נזרקת על הסיפון. תפוסת לוואי יכולה להגיע לכדי 90% מכלל התפיסה ודגים בסכנת הכחדה ואלמוגים בים עמוק נהרגים לרוב.
חומציות
ככל שהאקלים מתחמם, האוקיאנוס סופג יותר פחמן דו חמצני, מה שהופך אותו לחומצי יותר. חומציות מוגברת מעכבת את יכולתם של אורגניזמים ימיים לפתח קונכיות, וזה כולל את בעלי החיים הזעירים הנקראים פלנקטון המהווים את בסיס רשת המזון של האוקיינוסים. יש חוקרים המציעים כי הדבר גם יגרום לכמה מינים ימיים לפלוט פחות מתרכובות הגופרית המקדמות את היווצרות הענן, שמקרר את כדור הארץ. מודלים אקלימיים מנבאים שהדבר יגרום להתחממות נוספת של 0.5 מעלות צלזיוס (0.28 מעלות פרנהייט) במהלך המאה הזו.