תוֹכֶן
מדי שנה, כך מדווח אוניברסיטת סנטה קלרה, משמשים כ 20 מיליון בעלי חיים בניסויים רפואיים או לבדיקת מוצרים, רבים מהם גוססים בתהליך. תומכי זכויות בעלי חיים טוענים כי בדיקות כאלה אינן נחוצות ואכזריות, ואילו תומכי בדיקת בעלי חיים סבורים כי התועלת לבני אדם עולה על הסוגיות המוסריות.
אלטרנטיבות
טענה אחת נגד בדיקת בעלי חיים היא שלעתים קרובות יש אלטרנטיבות מקובלות יותר. לדוגמה, מדענים יכולים לבדוק אם כימיקלים יעצבנו את העיניים באמצעות הממברנה העשירה בכלי הדם המרפדת ביצית תרנגולות, במקום לחשוף את העיניים של בעלי חיים חיים לכימיקלים. תאים הגדלים במבחנה (במבחנה) והדמיות מחשב יכולים להציע מושג טוב כיצד בעלי חיים ובני אדם יגיבו לבדיקות מסוימות. המתנגדים לבדיקת בעלי חיים תומכים בשלוש Rs: החלפה (מציאת שיטות בדיקה אלטרנטיביות), הפחתה (שימוש בבדיקות בבעלי חיים כמה שפחות נדרש) ועידון (וודא שבדיקת בעלי חיים נעשית בצורה הכי אנושית וללא כאבים).
משתנים לא ידועים
עם זאת, חלופות לבדיקת בעלי חיים לא תמיד עובדות מכיוון שמערכת האורגניזם החי יכולה להיות בלתי צפויה. אם מדענים מבצעים בדיקות במודלים ממוחשבים, תאים שגדלו במבחנה או "אורגניזמים נמוכים" (כמו ביצים או חסרי חוליות, ולא חיות בעלות דם חם), הם עשויים שלא לראות תמונה מלאה של תוצאות הבדיקה כפי שהיו עושים בבדיקה על חיות חיות (או בעלי חיים הדומים יותר לבני אדם). על מנת להבין במלואה מערכת אורגניזמים חיים, על מדענים לבצע בדיקות בבעלי חיים בשלב מסוים.
אכזריות מיותרת
תומכי זכויות בעלי החיים טוענים כי בדיקה על בעלי חיים היא אכזרית ומיותרת. יש המחברים בין ניסויים בבעלי חיים לגזענות או לסקסיזם, וטוענים כי כל היצורים החיים ראויים לכבוד וכי גורם לבעלי חיים לסבול מכל סיבה שהיא אינו נכון מבחינה מוסרית. ד"ר טום רגאן, מוביל בתנועה לזכויות בעלי חיים, כותב כי לבעלי חיים "יש אמונות ורצונות; התפיסה, הזיכרון ותחושת העתיד. "הטענה לפיה בדיקת בעלי חיים עשויה להיות הכרחית אינה תירוץ מבחינה זו מכיוון שמדובר באחריות המדענים לגלות אלטרנטיבות אנושיות.
טובת הכלל
המצדדים בבדיקת בעלי חיים טוענים שזה הביא להתקדמות רבה במדע, והגדיל את איכות החיים של בני אדם ובעלי חיים כאחד. בדיקות בבעלי חיים סייעה לנו לפתח חיסונים, ניתוחים, טיפולי סרטן והתקדמות רפואית מצילה חיים אחרים. למרות שבדיקת בעלי חיים עלולה לגרום לכאב לבעלי חיים מעטים, רבים מאמינים כי טובת האנושות עולה על עלות זו.