תוֹכֶן
האטומים מורכבים משלושה חלקיקים טעונים באופן שונה: הפרוטון הטעון בחיוב, האלקטרון הטעון השלילי והנויטרון הנייטרלי. המטענים של הפרוטון והאלקטרון שווים בעוצמתם אך הפוכים בכיוון. הפרוטונים והנויטרונים מוחזקים יחד בתוך גרעין האטום על ידי הכוח החזק. האלקטרונים בתוך ענן האלקטרונים המקיפים את הגרעין מוחזקים לאטום על ידי הכוח האלקטרומגנטי החלש בהרבה.
TL; DR (יותר מדי זמן; לא קרא)
אלה פשוטים: לאלקטרונים יש מטען שלילי, לפרוטונים יש מטען חיובי והנויטרונים - כפי שמשתמע מהשם - הם ניטרליים.
פרוטונים
המרכיבים נבדלים זה מזה על ידי מספר הפרוטונים בתוך הגרעין שלהם. לדוגמה, לאטומי פחמן יש שישה פרוטונים בגרעין שלהם. אטומים עם שבעה פרוטונים הם אטומי חנקן. מספר הפרוטונים לכל יסוד ידוע כמספר האטומי ואינו משתנה בתגובות כימיות. במילים אחרות, האלמנטים בתחילת התגובה - המכונים המגיבים - הם אותם אלמנטים בסוף התגובה - המכונים התוצרים.
נויטרונים
למרות שלאלמנטים יש מספר ספציפי של פרוטונים, לאטומים של אותו יסוד עשויים להיות מספרים שונים של נויטרונים והם מכונים איזוטופים. לדוגמא, למימן שלושה איזוטופים, שלכל אחד מהם פרוטון יחיד. פרוטיום הוא איזוטופ של מימן עם אפס נויטרונים, לדוטריום יש נויטרון אחד ולטריטיום שני נויטרונים. למרות שמספר הנויטרונים עשוי להיות שונה בין איזוטופים, האיזוטופים כולם מתנהגים באופן דומה מבחינה כימית.
אלקטרונים
אלקטרונים אינם קשורים לאטום באותה מידה כמו פרוטונים ונויטרונים. זה מאפשר לאבד אלקטרונים, להשיג אותם או אפילו לשתף אותם אטומים. אטומים שמאבדים אלקטרונים הופכים ליונים עם מטען +1, מכיוון שיש כיום פרוטון אחד יותר מאלקטרונים. לאטומים שמשיג אלקטרון יש אלקטרון אחד יותר מפרוטונים והופכים להיות יון -1. קשרים כימיים המחזיקים אטומים יחד ליצירת תרכובות נובעים משינויים אלה במספר האלקטרונים וסידורם.
מסה אטומית
המסה של האטום נקבעת על ידי מספר הפרוטונים והנויטרונים בגרעין. לאלקטרונים יש חלק כה קטן ממסה בהשוואה לפרוטונים ונויטרונים, כי בדרך כלל לא מתעלמים מהם בעת קביעת מסת אטומים. סכום הפרוטונים והנויטרונים ידוע כמסה האטומית והוא שונה לכל איזוטופ. לדוגמא, לפרוטיום הידרוגנים איזוטופ יש פרוטון אחד ומסה אטומית של אחד. לדוטריום עם פרוטון אחד וניוטרון אחד יש מסה אטומית של שניים.
משקל אטומי
תגובות כימיות כוללות הרבה אטומים רבים, ובטבע, אטומים אלה הם תערובת של איזוטופים. המשקל האטומי של אלמנט הוא המסה האטומית של יסוד המשוקלל לאחוז האיזוטופים שנמצאים במדגם. רוב אטומי המימן הם איזוטופים של פרוטיום בעלי מסה אטומית של אחד. עם זאת, אחוז קטן מהאטומים הללו הם דאוטריום עם מסה אטומית של שניים וטריטיום עם מסה אטומית של שלושה. לפיכך, לדגימה של אטומי מימן יש משקל אטומי של 1.008 בגלל הכמות הקטנה של איזוטופים כבדים יותר אלה שמגדילה מעט את המסה האטומית הממוצעת. שימו לב שאחוז האיזוטופים עשוי להשתנות בין הדגימות אך לרוב הם דומים מאוד.