תוֹכֶן
כדי להבין מה זה אלל הומולוגי, עליכם להבין מהם הכרומוזומים, הגנים והמיקומים. ה- DNA של צמחים ובעלי חיים מאורגן לזוגות של כרומוזומים, שהם מיתרי גנים. גנים הם קטעי DNA המקודדים לתכונות ספציפיות. לוקוסים הם המיקומים בכל כרומוזום בו מוצבים הגנים.
זוגות סקסיים
מבין כל האורגניזמים על פני כדור הארץ, צמחים ובעלי חיים הם שתי הקבוצות שבדרך כלל התאמו כרומוזומים או דיפלואידים בגופם, או סומטיים, תאים. עם זאת, לאלה המתרבים מינית יש קבוצה מיוחדת של תאים המכונים תאי נבט, גמטות, או ביצים וזרע, שהם חסרי יכולת - לכל תא יש רק כרומוזום אחד מכל זוג בגנום הכולל. במהלך ההתרבות המינית תאים אלה משתלבים כך שעוברים חדשים יורשים כרומוזום אחד מכל זוג מכל הורה.
מגוון אינסופי
לכל כרומוזום יש סדרת לוקוסים שמתכתבים עם לוקוסים של שותפיו. הגנים המשויכים בקוד המקומי הללו לתכונות ספציפיות. לכל גן מספר וריאציות אפשריות. וריאציות שונות אלה נקראות אללים. האופן בו אדם חדש מבטא תכונה מסוימת תלוי בצורות המשתנות של כל האלל שהוא יורש מכל הורה.
אמצעי הומולוגי "אותו דבר"
לוקוסים מקבילים בכל כרומוזום משויך נקראים הומולוגים. אללים הומולוגיים הם האללים המאכלסים לוקוסים הומולוגיים אלה. הם מקודדים לאותה תכונה גם אם הם מכילים מידע שונה. לדוגמה, כרומוזום אחד עשוי להכיל אלל המקודד לצבע עיניים כחול. האלל ההומולוגי בכרומוזום השני בזוג עשוי לקוד את צבע העיניים החומות. צבע העיניים בפועל של האדם עם אללים אלה תלוי באילו דומיננטיים, רצסיביים, דומיננטיים משותפים או דומיננטיים חלקית.
אבל לפעמים זה קצת שונה
כאשר משווים בין קבוצות אורגניזמים שונים, ניתן לכנות גם אללים המקודדים לתכונות דומות כהומולוגים, אפילו אם הם אינם קיימים באותו לוקיישן או באותו כרומוזומים. לדוגמה, אללים המקודדים לצבע עיניים אצל בני אדם, תוכים, דג זהב וזבובי פרי הם כולם הומולוגים, למרות שהם עשויים להימצא במיקומים שונים מאוד בגנום המינים השונים.