תוֹכֶן
קשירת מימן חשובה בתהליכים כימיים רבים. קשירת מימן אחראית ליכולות הממס הייחודיות למים. קשרי מימן מחזיקים יחד גדילי DNA משלימים והם אחראים לקביעת המבנה התלת ממדי של חלבונים מקופלים כולל אנזימים ונוגדנים.
דוגמא: מים
דרך פשוטה להסביר קשרי מימן היא עם מים. מולקולת המים מורכבת משני הידרוגנים הנקשרים באופן קוולנטי לחמצן. מכיוון שחמצן הוא אלקטרונגטיבי יותר ממימן, החמצן מושך את האלקטרונים המשותפים לעצמם יותר קרוב. זה נותן לאטום החמצן מטען שלילי מעט יותר משני אטומי המימן. חוסר איזון זה נקרא דיפול, וגורם למולקולת המים להיות צד חיובי ושלילי, כמעט כמו מגנט זעיר. מולקולות מים מתיישרות כך שהמימן על מולקולה אחת יתמודד עם החמצן במולקולה אחרת. זה נותן למים צמיגות גבוהה יותר וגם מאפשר למים להמיס מולקולות אחרות שיש להן מטען מעט חיובי או שלילי.
קיפול חלבונים
מבנה החלבון נקבע באופן חלקי על ידי קשירת מימן. קשרי מימן יכולים להתרחש בין מימן באמין לבין יסוד אלקטרונגטיבי, כמו חמצן בשאריות אחרות. כאשר חלבון מתקפל למקומו, סדרה של קשר מימן "מכווצת" את המולקולה יחד, ומחזיקה אותה בצורה תלת ממדית ספציפית המעניקה לחלבון את תפקידו הספציפי.
DNA
קשרי מימן מחזיקים יחד גדילי DNA משלימים. נוקליאוטידים מתיישרים באופן מדויק על סמך עמדתם של תורמי קשר מימן זמינים (הידרוגנים זמינים, מעט חיוביים) ומקבלי קשר מימן (אוקסיגנים אלקטרוניים). לתאמין של נוקליאוטידים יש תורם אחד ומקבל אתר אחד המתיישרים בצורה מושלמת עם אתר התורמים המשלים ואתר התורמים. ציטוזין מזווג באופן מושלם עם גואנין דרך שלושה קשרי מימן.
נוגדנים
נוגדנים הם מבני חלבון מקופלים אשר מכוונים ומתאימים בדיוק לאנטיגין ספציפי. ברגע שהנוגדן מיוצר ושומר על צורתו התלת מימדית (בעזרת קשר של מימן), הנוגדן יתאים כמו מפתח במנעול לאנטיגן הספציפי שלו. הנוגדן יינעל באנטיגן באמצעות סדרה של אינטראקציות הכוללות קשרי מימן. לגוף האדם יש יכולת לייצר למעלה מעשרה מיליארד סוגים שונים של נוגדנים בתגובת חסינות.
קלציה
אמנם קשרי מימן בודדים אינם חזקים במיוחד, אך סדרה של קשרי מימן היא מאוד בטוחה. כאשר מולקולה אחת מימן נקשרת דרך שני אתרים או יותר עם מולקולה אחרת, נוצר מבנה טבעתי המכונה צ'לט. תרכובות צ'לטציה מועילות להסרת או גיוס מולקולות ואטומים כמו מתכות.