תוֹכֶן
מבנה ה- DNA הכפול גדילי הוא אוניברסאלי בכל התאים החיים, אך הבדלים מתרחשים בשיטות להפקת DNA גנומי מתאי בעלי חיים וצמחים. אף על פי ש- DNA גנומי חי בגרעין התאים, הכמות והטוהר של ה- DNA המופק תלויה בסוג התא ובגודל. לדוגמא, תאים מסוימים מכילים יותר DNA וזיהומים מאחרים. המשך לקרוא כדי ללמוד עוד על הבדלי מיצוי DNA.
מיצוי DNA כללי
אם מטפלים בתאי צמח ובעלי חיים בחומר סבון, זה ישפיל את הליפידים בתא ובקרומי הגרעין. לאחר מכן, תערובת ה- DNA תיפרד מממברנות התא והחלבונים. בשלב הבא תוכלו להשתמש באלכוהול בכדי לזרז את ה- DNA שבתמיסה. תלוי בכמות שבדגימה, DNA עשוי להיות גלוי בעין בלתי מזוינת. עם זאת, יש לזכור כי הליך פשוט זה אינו בהכרח מייצר DNA בעל טוהר גבוה.
תאים צמחיים ובעלי חיים
תאי צמחים שונים מתאי בעלי חיים בגלל דופן התא הנוקשה שלהם ואברונים כמו הכלורופלסט. הם מכילים גם חלבונים ואנזימים הממלאים תפקיד בפוטוסינתזה. בחלק מתאי הצמח יש פוליפלואידי, כלומר יש להם יותר מעותק אחד של כל כרומוזום בכל תא. בנוסף, תהליכים סלולריים המתרחשים בצמחים כמו פוטוסינתזה מייצרים מגוון מטבוליטים משניים. לתאים בבעלי חיים אין קיר תא, אך עדיין זקוקים לכימיקלים כמו נתרן דודציל סולפט (SDS) כדי לשבש את קרום התא בכדי לשחרר DNA גנומי.
מיצוי DNA מצמחים
ה- DNA הגנומי מהצומח קשה יותר לחילוץ בגלל דופן התא של הצמח. אתה יכול להסיר אותו על ידי הומוגניזציה או על ידי הוספת תאית כדי להשפיל את התאית המרכיבה את דופן התא. בנוסף המטבוליטים הקיימים בתא הצמח עשויים להפריע למיצוי DNA גנומי על ידי זיהום דגימת ה- DNA בתהליך המשקעים.
מיצוי DNA של בעלי חיים
לויקוציטים בדם היקפיים הם המקור העיקרי ל- DNA הגנומי של בעלי החיים, אך איסוף הדגימות קשה מכיוון שהדם חייב להגיע ישירות מהבעלי חיים. הדם מכיל מגוון תרכובות כמו חלבונים, ליפידים, תאי דם לבנים, תאי דם אדומים, טסיות דם ופלזמה, שיכולים לזהם את דגימת ה- DNA. עם זאת, המזהם העיקרי של ה- DNA מהחי שמופק מדגימות דם הוא heme, שהוא המרכיב הלא חלבוני של המוגלובין.
ההבדלים ב- DNA
ההבדלים בין DNA מהצומח לבעלי החיים טמונים ברצף הבסיסים בסליל. תרכובות שנמצאות בתאי צמח נעדרות בתאים מן החי, ורצפי בסיס DNA משקפים זאת. כמו כן, ה- DNA של הצמח הגנומי לרוב גדול יותר מ- DNA מהחי. הבדלים אלה משפיעים גם על שיטות מיצוי, תשואה וטוהר ה- DNA.