תוֹכֶן
חומצה דהוקסיריבונוקלאית, או DNA, התגלתה בשנת 1953 על ידי ג'יימס ווטסון, פרנסיס קריק ורוזלינד פרנקלין. מולקולה זו נחשבת כבסיס הבסיסי לחיים, מכיוון שהיא מכילה את המידע לבניית חלבונים ומבנים הנדרשים בכל האורגניזמים. ה- DNA של כל בני אדם הוא ייחודי מבחינת הרצף של אלפי זוגות הבסיס החנקניים האינדיבידואליים שלו, בדיוק כמו שכל ספר מכיל מילים אך אין שני ספרים מכילים אותם משפטים או אותה סדר מילים.אך כל ה- DNA הוא בצורת מבנה פשוט, סליל כפול, המורכב מסדרה חוזרת של קבוצות פוספט, סוכרים חמישה פחמן ובסיסים חנקניים, המוצגים באופן סכמטי כמו A, C, G ו- T.
ניתן לבנות דגמים של DNA ממגוון פריטים יומיומיים הזמינים. מודלים כאלה משמשים כלים חשובים לתקשורת על יסודות היצירה הטבעית האלגנטית הזו.
המבנה הבסיסי של ה- DNA
ניתן לתפוס סליל כפול כסולם ארוך וגמיש מאוד, כאשר צידי הסולם מפותלים בכיוונים מנוגדים משני קצוותיו, והתוצאה היא צורת ספירלה. "המשטחים" הם קשרי המימן בין זוגות הבסיס הסמוכים, כאשר A (אדנין) נקשר רק ל- T (תימין) ו- C (ציטוזין) שנקשרים רק ל- G (גואנין). כל בסיס נקשר לסוכר (חמש פחמן) חמש פחמן מול הקשר המימני שלו, וסוכרים אלה נקשרים זה לזה לאורך צידי ה"סולם "דרך קבוצת פוספטים (P) שביניהם.
מידת הפיתול חשובה כדי להמחיש למטרות ייצור מודלים של מולקולת ה- DNA. הסליל הכפול עושה "טוויסט" שלם בערך כל חמש עד שישה זוגות בסיס. אך לכל דגם נכון צריך להיות זכות יסוד בלבד: הסוכרים, הפוספטים והבסיסים חייבים כולם להיות במיקומם הנכון ביחס זה לזה.
דגמי חטיבות ביניים: פריטים ממוחזרים
רוח של שימור סביבתי יכולה להופיע בבניית דגמי DNA. לאחר התייעצות עם תרשים המפרט את המבנה הבסיסי של המולקולה, שקול כמה סוגים שונים של חפצים ייחודיים נדרשים כדי לייצג אורך של DNA. (התשובה היא שש: אחת כל אחת עבור A, C, G, T, S ו- P.) עבד לבד או בקבוצות, צץ עם רשימות של פריטים בפחי מיחזור לבית הספר או לבית שעלולים להתאים ביניהם לכדי יצירת מודל של המולקולה.
הפריטים שנבחרו חייבים להיות בגודל דומה, ולא גדולים מדי, כדי ליצור דגם מדויק. לדוגמה, ניתן לשלב סוג אחר של פח סודה לכל אחד מארבעת הבסיסים עם שימוש במנות של קרטוני ביצים לסוכרים ומקלות ארטיק לקבוצות הפוספט.
דגמי תיכון: לחפור עמוק יותר ב- DNA
כשעושים מודלים של DNA מורחבים יותר, אתגר אחד הוא להסביר מדוע A עשוי להזדווג עם ורק עם T ובדומה ל- C ו- G. (התשובה היא שברמת הקונפורמציה התלת מימדית שלהם בחלל, A נוטה ל משתלבים עם T באופן של נניח, חתיכות פאזל.) דגם חימר עם חוט גמיש היוצר את עמוד השדרה של "הקווים" וה"צדדים "הוא דרך אידיאלית לייצג זאת. השתמשו בצבעים שונים של חימר עבור ארבעת סוגי הבסיס, וגשו צורות סבירות שונות לכל אחת; הם צריכים להיות רק עקביים ולעמוד בקריטריונים של "פיסות התאמה".
לקבלת אשראי נוסף, טענו השערות לגבי הסיבה ש- DNA מסובב את עצמו לסליל כפול ולא להישאר בצורת סולם בסיסית. (תשובה: המטענים החיוביים והשליליים על המולקולות השונות מושכים ומדפים זה את זה בצורה כזו להבטיח כי הסליל הכפול הוא הדרך היחידה למולקולה להתקיים בצורה יציבה.)